| Картинка со схематическим изображением доменной структуры ISCS_Ecoli |
|
||||||||
|
Картинка с доменами, отмеченными на пространственной структуре ISCS_Ecoli (идентификатор PDB - 1P3W)
Цвет, в который окрашен домен на пространственной структуре соответствует цвету, в который он окрашен на схематическом изображении (для нашего домена это зеленый). Часть молекулы, не содержащая доменов, имеет серый цвет. |
|
||||||||
| Домены в последовательности ISCS_Ecoli |
|
Описание N-концевого домена белка ISCS_ECOLI
Домен PF00266 встречается в аминотрансферазах и других ферментах, включающих цистеин десульфуразу.
Организмы, в которых найдены белки с доменами PF00266:
|
Таксон
|
Количество белков с доменом PF00266
|
|
| Эукариоты | Растения | 58 |
| Грибы | 152 | |
| Животные | 134 | |
| Бактерии | 2805 | |
| Археи | 134 | |
Всего известно 3509 последовательностей белков с доменами PF00266. В абсолютном большинстве случаев - в 3170 последовательностях - этот домен является единственным в белке. Случаи дупликации домена не известны. Случаи перестановки 2-х доменов местами, если один из них PF00266, также не выражены. Существуют последовательности, в которых домен разрывается на 2-3 части.
Картинка с изображением всех подписей в белке
Мотивы в белке ISCS_Ecoli по данным БД InterPro
|
Название подписи
|
Положение в последовательности ISCS_Ecoli
|
Полное название базы данных
|
* Название
организации, поддерживающей данную БД.
|
* Город
и страна
|
|
Aminotran_5
|
5-369
|
Pfam
|
Wellcome Trust Genome Campus
|
США, Кембридж
|
|
AA_TRANSFER_CLASS_5
|
197-216
|
PROSITE pattern
|
Swiss Institute of Bioinformatics
|
Швейцария, Женева
|
|
IscS
|
1-404
|
TIGRFAMs
|
The Institute for Genomic Research (TIGR)
|
США, Рокквилль (Мэрилэнд), La Jolla (Калифорния)
|
|
PyrdxlP-dep_Trfase_major_sub
|
5-262
|
Gene3D
|
UCL (University College London) Biochemistry Biocomputing Group
|
Англия, Лондон
|
|
PyrdxlP-dep_Trfase_major
|
3-380
|
SuperFamily
|
The Medical Research Council
|
Англия, Лондон
|
|
NifS
|
1-384
|
PIRSF (Protein Information Resource)
|
Georgetown University Medical Center
|
США, Вашингтон
|
|
PTHR11601
|
4-404
|
PANTHER (Protein ANalysis THrough Evolutionary Relationships)
|
Protein Informatics, Celera Genomics
|
США, Фостер, штат Калифорния
|